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產品列表PRODUCTS LIST

實驗服務 高通量測序

簡要描述:

服務說明:
1、提供實驗材料,其必須保證新鮮,請您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩定劑。
2、如果提供DNA,我們要對其進行評估?;蚪MDNA無明顯降解,濃度≥500&#160;ng/ul,總量
&#160;&#160; 大于30μg。
3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA&#160;,也可以將樣品研

更新時間:2021-03-18

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高通量測序

 

服務編號服務項目收費標準(元)實驗周期
FZ32基因組de novo測序面議面議
FZ33基因組重測序面議面議
FZ34宏基因組測序面議面議
FZ35小RNA測序面議面議
FZ36真核生物轉錄組測序面議面議
FZ37簡化基因組測序面議面議
FZ38細菌16S測序

產品介紹:
服務內容:
基因組de novo測序
1  基因組DNA提取
2  構建不同長度的基因組文庫
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  基因組拼裝統計:原始數據統計、測序深度分析、覆蓋度統計、GC含量分析等;
6  基因組注釋:基因預測、基因功能注釋、重復序列分析、nocoding RNA注釋等;
7  基因功能分析 GO分析,KEGG通路分析等;
8  比較基因組學及進化分析:物種系統發育樹構建、基因家族鑒定、基因共線性分析等。
 
基因組重測序
1  基因組DNA提取
2  構建基因組測序文庫
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  序列比對
6  SNP、 InDel、CNV、SV檢測等
 
宏基因組測序
1  基因組DNA提取
2  構建基因組測序文庫
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  宏基因組組裝:原始數據統計、測序深度分析、覆蓋度統計、GC含量分析等;
6  樣品復雜度分析:將測序所得Reads與業數據庫進行比對統計;
7  物種分類:基因預測、相對豐度計算等;
 
真核生物轉錄組測序
1  RNA提取
2  構建測序文庫
3  上機測序
4   數據分析:
     無參考基因組的轉組分析
Ø 基本數據處理(圖像識別,堿基識別,測序街頭序列過濾,樣品污染可能性檢測)
Ø 測序數據產量統計,數據成分和質量評估;
Ø Contig及Scaffold長度分布;
Ø Unigene的長度分布,GO分類,功能注釋,代謝通路分析,表達差異分析。
有參考基因組的轉錄組分析
Ø 基本數據處理(圖像識別,堿基識別,測序街頭序列過濾,樣品污染可能性檢測);
Ø 與參考基因組比對后的注釋信息;
Ø 基因在基因組上的分布;
Ø 測序深度分布,測序隨機性評估,基因差異表達分析;
 
Small RNA測序
1  RNA提取
2  連接接頭及純化Samll RNA
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  樣品間的公共序列和特異序列的分析
6  Small RNA 與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比對信息
7  Small RNA 與重復序列的比對信息(需提供選定參考基因組對應的重復序列注釋信息);
8  Small RNA 與 miRBase 中范圍的已知的 miRNA 的比對;
9  按照優先將 small RNA 進行分類注釋; 
10 利用Mireap 對沒有注釋的small RNA 進行預測,預測新的 miRNA ;
11樣品間miRNA 差異分析(2個或2個以上樣品)和聚類分析(3個或3個以上樣品) ;
12  MiRNA 靶基因預測(需要提供基因編碼序列);
 
簡化基因組測序
1  基因組DNA提取 酶切 接接頭
2  上機測序
3  數據分析
 
未知參考基因組的信息分析流程
Ø 原始數據整理、過濾及質量評估;
Ø 標記位點分析(標記位點鑒定,SNPs位點與InDel位點鑒定);
Ø 全基因組關聯分析(GWAS);
Ø 連鎖分析和QTL定位;
Ø 種群進化分析。
已知參考基因組的信息分析流程      
Ø 原始數據整理、過濾及質量評估;
Ø 標記位點分析(標記位點鑒定,SNPs位點與InDel位點鑒定);
Ø SNP單體型圖譜分析;
Ø 全基因組關聯分析(GWAS);
Ø 連鎖分析和QTL定位;
Ø 種群進化分析。
 
細菌16S rDNA測序
 
1  基因組DNA提取 PCR擴增
2  上機測序
3  原始數據整理、過濾及質量評估;
4  OTU列表生成及注釋;
5  豐度分析(Alpha多樣性分析、物種豐度差異分析、聚類分析);
6  群落結構分析(單樣品物種分布、 多樣品物種分布、含進化關系的
物種分布、Beta多樣性分析)。
服務說明:
1、提供實驗材料,其必須保證新鮮,請您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩定劑。
2、如果提供DNA,我們要對其進行評估?;蚪MDNA無明顯降解,濃度≥500 ng/ul,總量
   大于30μg。
3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA ,也可以將樣品研磨后放在 Trigol中。
4、如果提供RNA,我們需要我們評估請提供濃度≥500 ng/ul,總量≥20 ug 的total RNA樣品
   樣品請去蛋白并進DNase處理。
 

 

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